剖腹手术、腹腔镜手术、药物
目前子宫外孕的治疗主要有三种：1剖腹手术；2腹腔镜手术；3药物治疗。原则上，采取药物治疗需要符合药物治疗的条件；而手术治疗也必须符合治疗条件，且手术分为保守性手术与根除性手术。至于剖腹手术则较少使用，除非是特殊的子宫外孕。常见的子宫外孕多为输卵管怀孕，主要采取腹腔镜手术或药物治疗。
药物治疗
治疗癌症的药物
药物治疗是以治疗癌症的药物来进行，具有毒性，其作用是杀死胚胎。治疗前，会先检验患者的肝脏、肾脏功能是否正常、是否患有十二指肠溃疡、肺部之病史，或白血球值是否过低。有上述异常情形不可进行药物治疗。此外，采取药物治疗必须符合以下条件：
1肿块完整无破裂：肿块破裂会造成腹腔积血，患者的血压也不断下降，此时应立即开刀。
2肿块小于3.5公分且不能有心跳：倘若出现心跳表示肿块不小，最好别采取药物治疗以免失败率高。
3怀孕的血液β-HCG浓度小于1万5千：怀孕的血液浓度太高亦不适合药物治疗。
4遵照医嘱：最重要是患者必须信任医师、遵照医嘱。进行药物治疗时，第一天是注射针剂，而第4天与第7天要进行抽血β-HCG浓度，甚至必须追踪将近2个月。如果病人无法接受医嘱，原则上不建议进行药物治疗以免发生危险。主要是担心病人在不自觉的情况下，肿块破裂造成大出血，可能会引发休克、甚至死亡。
虽然国外的医学研究指出药物治疗成功比例有90%，不过，患者要符合良好健康状况、胚囊小、肿块不大且未破裂、血液β-HCG浓度不高等条件，而且还要定期回诊追踪。
手术治疗
腹腔镜手术伤口小、复原快
当患者到院就诊时，出现血压不稳并持续下降、腹痛情况严重、肿块破裂等，应立即接受手术治疗。除此，若子宫外孕患者未符合药物治疗的条件，或难以持续进行1～2个月的追踪，亦建议开刀。
至于手术治疗则是以腹腔镜手术为主，主要是腹腔镜手术的伤口小，病人恢复快，通常开完刀的第二天即可出院。
预后状况
一般来说开刀治疗会采取两种方式，一种是保守型，亦即切开输卵管取出怀孕的肿块；另一种则是切除怀孕的输卵管。如果切开输卵管取出妊娠物则必须密切追踪血液β-HCG浓度，因为无法确定是否完全取出妊娠物，而且有4～15%机率再度持续性子宫外孕，一旦发生此情形可能须再进行药物治疗。
若直接切除输卵管，会减少持续性的子宫外孕机率。正常来说，一般女性有两条输卵管，如果只切除一边而另一边正常，仍可怀孕。如果切除两条，则再也无法怀孕，必须进行人工生殖。
预防之道
早期发现、积极治疗，保住生育力。
子宫外孕的原因除了起于输卵管发炎，也可能是受精卵提早在输卵管着床造成，也因此子宫外孕难以预防。不过即使如此，女性仍应避免骨盆腔感染，一旦骨盆腔受到感染，还是增加子宫外孕机率。」而且，尽可能防止不洁的性行为，并使用保险套。除此，建议妇女别养成抽烟习惯，抽烟会降低身体的免疫力，影响输卵管的活动力。
别轻忽身体的警讯！
子宫外孕的再发率15%
此外，曾发生一次子宫外孕的妇女，将来子宫内怀孕的机率是38～89%。若发生两次子宫外孕，即使输卵管没切除亦会降低怀孕机率。再者，子宫外孕的发生不一定与年纪相关，其实每个年龄层都有，主要还是与输卵管是否受到感染、以及不洁的性行为较相关。
至于发生子宫外孕后，再发机率约为15%。因此子宫外孕不能掉以轻心，尤其是在初期怀孕造成母亲死亡率的原因。一旦子宫外孕的妊娠物破裂并造成大出血，通常出血量可达上千C.C以上，如果患者没有注意，也许昏倒在家未被发现，则可能造成休克甚至危及性命。
早期诊断、早期发现
原则上一旦发现月经延迟、有不正常出血、或下腹痛情形，建议询问妇产科医师，已怀孕的妇女别以为这只是轻微疼痛而轻忽了，认为产检再询问医师即可。至于不确定自己是否怀孕的妇女，一旦发现月经稍微慢了几天，而且腹部疼痛，千万别认为只是经期紊乱，最好还是谨慎以对。早期诊断、早期发现，并积极治疗以保住生育力。