1、驱寒暖身
藿香正气水中含有的成分，如藿香、紫苏等均是性温的食物，具有驱寒的作用，加上泡脚用的热水可通络活血，驱寒暖身，因此用其泡脚用来抵抗吹空调或寒冷天气造成的体寒很有效果。
2、杀菌
藿香正气水中含有的厚朴有广泛抗菌作用，其对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、痢疾杆菌等均有抑制作用；紫苏对大肠杆菌、痢疾杆菌、葡萄球菌等也有抑制作用，因此用其泡脚能很好的杀菌。
3、增进消化
藿香和紫苏都含有含挥发油，能促进胃液分泌，在用藿香正气水泡脚的过程中，这些带有芳香气味的物质可增强食欲和消化机能，对于胃口不好，肠胃消化功能较弱的人而言十分管用。