关于地球物种多样性的形成机制目前还有一定的争议。
理论一：生态位理论。
早在1910年Johnson就率先提出了生态位概念。
之后，Grinnell正式定义生态位（niche）为正好被一个种(或亚种)所占据的环境限制性因子单元。
然而，传统的生态位理论在解释热带雨林的物种多样性时遇到了困难:热带雨林的物种多样性太高，无法用传统的生态位分化观点来解释，即没有足够数量的生态位容纳如此众多的雨林树种。
理论二：以美国生态学家Stephen Hubbell为代表的学者提出了群落中性理论。
该理论否定“筛子”的存在（即环境的选择作用），强调随机性和动态变化，他们认为宏观进化结果都来自于等位基因在遗传漂变中的随机固定，不像“环境适应—选择论者”把基因分为“好”和“坏”的，他们认为基因没有好坏之分，是“中性”的，所以称为中性理论。
物种可以实现共存，物种多度的变化是随机的，而非确定性的;共存的物种数量取决于物种分化（或迁入）和随机灭绝之间的平衡;群落内物种的相对多度随时间表现为随机振荡的波动。