DNA的两条链都能作为模板，因为两条链碱基序列是不一样的，所以转录的RNA也不同，最终翻译出来的蛋白质也不同。但是对于特定的基因来说，转录的链是确定的。
DNA分子在复制过程中，由双螺旋结构解旋后解开的两条单链，也叫做模板链。
DNA复制的计算规律：每次复制的子代DNA中各有一条链是其上一代DNA分子中的，即有一半被保留。一个DNA分子复制n次则形成2n个DNA，但含有最初母链的DNA分子有2个，可形成2Ⅹ2n条脱氧核苷酸链，含有最初脱氧核苷酸链的有2条。子代DNA和亲代DNA相同，假设x为所求脱氧核苷酸在母链的数量，形成新的DNA所需要游离的脱氧核苷酸数为子代DNA中所求脱氧核苷酸总数2nx减去所求脱氧核苷酸在最初母链的数量x。