1. 交易场所不同。深证全称深圳证券交易市场，地址在深圳;上证全称上海证券交易市场，地址在上海。
2. 构成指数不同。上证指数是把在上证上市的所有股票加权平均得出来的指数;深成指是深证按标准选出来的500家具有代表性的上市公司作为成分股，用成分股的可流通数作为权数，以加权平均法计算得出。所有深成指的算法更像美国道琼斯工业指数。
3. 股票代码不一样。上证主板A股代码以6开头(比如中国重工/中国联通)、科创版以7开头、B股股票代码以900开头(比如老凤祥B)、新股申购以730开头、配股代码以700开头。深证主板A股代码以000开头(比如万科A)、中小板以002开头、创业板以3开头(比如第一只创业板股票特锐德)、B股代码以200开头、新股申购代码以00开头、配股代码以080开头。
4. 新股申购基数单位不同。上证每1000股为一个基数单位，深证每500股是一个基数单位。
5. B股标价不同。上证以美元竞价，深证以港币竞价。
6. 上证采用指定交易，深证采用自动托管，随处通买。