结构性存款是受存款保险制度保护的，根据相关规定，结构性存款纳入商业银行表内核算，按照存款管理，要求银行纳入存款准备金和存款保险的范围。但与普通存款不同，普通存款是本金与利息都在存款保险制度的保障范围内，结构性存款只有本金享受保护。
而利息部分，由于与金融类产品或者非金融类产品挂钩，按照衍生产品交易管理，所以不享受存款保险制度的保护。
结构性存款，是指投资者将合法持有的人民币或外币资金存放在银行，由银行通过在普通存款的基础上嵌入金融衍生工具（包括但不限于远期、掉期、期权或期货等），将投资者收益与利率、汇率、股票价格、商品价格、信用、指数及其他金融类或非金融类标的物挂钩的具有一定风险的金融产品。
事实上，结构性存款不是普通存款，也不同于银行理财。结构性存款在存款的基础上嵌入金融衍生工具，通过与利率、汇率、指数等的波动挂钩，使存款人在承担一定风险的基础上获得更高收益。