阿坝州州府是在马尔康市。
阿坝藏族羌族自治州位于青藏高原东南缘，北和西北与甘肃、青海交界，东和东南与绵阳市、德阳市、成都市相邻，南和西南与雅安市接壤，西与甘孜州相连。南北长约414公里，东西宽约360公里，幅员84242平方公里。
阿坝藏族羌族自治州境内垂直气候显著，冬季寒冷而漫长，夏季北部温凉、南部温热且短暂，大部分地区春秋季相连，干雨季分明。光照充沛，昼夜温差大，无霜期短。冬春季节空气干燥，多阵性大风，旱、霜、雪、低温、大雪各类灾害性天气频繁。全州属于高原季风气候，分高山、山原、高山河谷三种气候类型。