1、应用范围不同
艾条：使用简便，不起泡，不发疮，无痛苦，患者还可以自灸，故现代临床应用更为广泛。
艾柱：通常应用于随行灸（即随身灸）、关节灸器、单柱双柱灸器、火龙罐、这些灸器内。
2、外观大小不同
艾条：是用棉纸包裹艾绒制成的圆柱形长卷，分为清艾条、纯艾条、药艾条等，艾条长度范围在0.2cm~30cm之间（长度小于80mm的艾条，可称艾柱、艾段），直径范围在0.4cm~6cm之间，其中最常见的长度是20cm，直径是1.8-7cm之间。
艾柱：其实是比较短的艾条，市面上常见的艾柱直径大约是1.5cm~6cm，长度大约是2.5cm~6cm左右。其大小根据需要而定，小的如米粒，多用于直接灸；大的如蚕豆，多用于间接灸。
新手用艾条好还是艾柱好
如果你是新手的话，刚开始接触艾灸，用随身灸配合艾柱是最好的，操作简单艾烟比较小的。
如果你是艾灸一段时间的朋友，能够习惯艾烟的话，可以用木盒或者手持艾灸。
如果你确实不习惯艾烟的话，那么可以试试无烟的艾条，无烟的艾条通常是艾绒碳化处理过的，是黑色的艾条，这种没有什么艾烟，艾灸效果也不错，但是总体来讲比有烟的效果轻微差一些，而且无烟艾条点燃的话，通常是需要用蜡烛后者酒精灯点燃的。