大蒜根系分布浅，根毛少，吸肥能力弱，对基肥的数量和质量要求比较高。
基肥要以有机肥为主，有机肥料通常是指猪圈肥、人粪尿、鸡鸭粪、厩肥、饼肥、堆肥等。
这些肥料养分全面，含量高，肥效长，作用大。
根据大蒜需肥较多的特点，基肥施用量是否充足，直接关系到大蒜蒜头的商品性和植株的越冬性能，因此在生产上应尽量施足基肥。
大蒜的基肥施用量应根据大蒜的目标产量和形成单位产量的吸肥量等多种因素综合考虑。
一般每亩产蒜头1000～1500千克时，要求施用猪粪尿2500～3000千克，或厩肥4500～5000千克，也可用人粪尿500～750千克。
有条件的可每亩施用棉籽饼50～100千克，或豆饼50千克左右。
也可用苜蓿等绿肥压青、鲜草沤造作基肥施用。
配合有机肥作基肥施用的化肥通常有过磷酸钙、氮磷复合肥、氮钾复合肥或三元复合肥等。