鲜奶和酸奶的蛋白质、脂肪及维生素等营养成分相差不大，二者可以相互替代。二者区别是：
酸牛奶的蛋白质和脂肪更易被人体吸收，钙、磷、铁等的利用率也大大提高。酸奶中的乳酸菌产生乳酸等有机酸，这些有机酸有效地降低了肠道的酸碱度，从而可以有效地抑制肠道内有害病菌的繁殖。酸奶可使肠道内的有益细菌增加，维持肠道菌群的平衡。酸奶还可以促进唾液和胃液的分泌，增进食欲，增强肠胃消化功能，治疗青少年便秘、消化不良等症。
但酸奶不能加热喝，而牛奶可以加热喝，对一些胃怕凉的人来说喝鲜奶比较合适。酸奶的含糖量高一些，不太适合胖人和正在减肥的人喝。婴儿肠胃发育不健全，也不适合喝酸奶，最好喝牛奶。
另外，酸奶的酸性物质易腐蚀牙齿，饮后更要注意漱口。
酸奶比纯奶更易于钙的吸收