1. 两者配置不同：负离子吹风机主要是内装了一个负离子发生器和一个半导体制冷装置，这样，吹风机工作时就可产生带负电的离子微粒（由负离子发生器产生）和水蒸气粒子（由半导体制冷装置产生），中和头发中常有的正电荷，从而抚平乱发，使其贴服顺滑，还可以消除静电。普通的吹风机则没有这一装置，没有此功能。
2. 功能不同：普通吹风机在工作中会加热，吹出来的风使头发干燥，而使用中也免不了使用梳子，这样一来头发就很容易产生静电，而静电会使头发变型，弯曲，或翘起，负离子风机里面根据设计特制网状线，(或负离子发生器)吹出来的风带着负离子，就不会产生静电，从而不伤头发。
3. 工作原理不同：负离子发生器是一种生成空气负离子的装置，该装置将输入的直流或交流电经EMI处理电路及雷击保护电路处理后，通过脉冲式电路，过压限流;高低压隔离等线路升为交流高压，然后通过特殊等级电子材料整流滤波后得到纯净的直流负高压，将直流负高压连接到金属或碳元素制作的释放，利用直流高压产生高电晕，高速地放出大量的电子。