两家土地确权可以分开。应该由承包方对承包地分割达成一致意见后，准备好相关土地的承包经营权证，向发包方提出申请，由发包方报经县乡农村土地承包管理部门审核同意后，分别与分立后的农户重新签订承包合同，县级农村土地承包管理部门依法办理变更登记，并分别向分离后的农户换发农村土地承包经营权证书。
法律依据：
《中华人民共和国物权法》第九十三条规定，不动产或者动产可以由两个以上单位、个人共有。共有包括按份共有和共同共有。按份共有人对共有的不动产或者动产按照其份额享有所有权。共同共有人对共有的不动产或者动产共同享有所有权。