真核细胞的基因也是由编码区和非编码区两部分组成的。外显子能编码蛋白质的序列，特点：间隔的、不连续的。即能编码蛋白质的序列被不能编码蛋白质的序列分隔开来，成为一种断列的形式， 包括：
1. 编码区：内含子是不能编码蛋白质的序列。
2. 非编码区： 有调控作用的核苷酸序列。
真核生物基因组有以下特点：
1. 真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，除配子细胞外，体细胞内的基因的基因组是双份的，即有两份同源的基因组。
2. 真核细胞基因转录产物单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA分子和一条多肽链。
3. 存在重复序列，重复次数可达百万次以上。
4. 基因组中不编码的区域多于编码区域。
5. 大部分基因含有内含子，因此，基因是不连续的。
6. 基因组远远大于原核生物的基因组，具有许多复制起点，而每个复制子的长度较小。