托克逊县位于新疆维吾尔自治区中东部，天山南麓，吐鲁番盆地西部。
东与吐鲁番市为邻，南与巴州尉犁县相接，西与巴州的和硕、和静县相连，北与乌鲁木齐市毗邻。
县城托克逊镇距乌鲁木齐市公路里程162千米。
总面积16171、47平方千米。
有维吾尔、汉、回等12个民族。
华夏第一州巴音郭楞蒙古自治州300公里，南疆重轨复线铁路县内穿过，货运火车站3个。
均为高速、高等级公路，兰新铁路、312、314国道纵横贯穿县境。
三面山地环绕，西、北面高而东部低，盆地自西北向东南倾斜的地貌特征，地势高低悬殊。
有阿拉沟、白杨河等6条河流。
属暖温带干旱荒漠气候，夏季气候炎热，昼夜温差大，多风，年均气温13、8摄氏度，极端最高气温为48摄氏度，年平均积温在5600摄氏度以上，年光照率百分之六十九，无霜期276天，年均降水7毫米，是中国降水最少的地方。