脱氢乙酸钠与山梨酸钾相比，它对人体的危害主要来源于它的不正当的使用方法，因为在温热的潮湿空气中脱氢乙酸钠会不稳定。随即分解出氢化物和钠盐，钠盐对人体影响小，但这种氢化物对人体的毒性与山梨酸钾相比不止百倍。
脱氢乙（醋）酸钠是联合国粮农组织(FAO)和世界卫生组织(WHO)认可的一种安全型食品防霉、防腐保鲜剂，是继苯甲酸钠、尼泊金、山梨酸钾之后，新一代的食品防腐剂。
脱氢乙（醋）酸钠在体内无残留，在新陈代谢中逐渐降解为乙（醋）酸，因而对人体无害。目前证实，其长期接触不会对皮肤造成刺激性的伤害，同时不影响食品口感和风味。