1. 脾胃虚寒及月经期间的妇女不宜生吃，圣女果含有大量可溶性收敛剂等成分，与胃酸发生反应，凝结成不溶解的块状物，容易引起胃肠胀满、疼痛等不适症状。如果只把圣女果当成水果吃补充维生素C，或盛夏清暑热，则以生吃为佳。
2. 不宜吃未成熟的青圣女果，因为青色的圣女果含有大量的有毒番茄碱，食用后会出现恶心、呕吐、全身泛力等中毒症状。而成熟呈红色后，番茄碱的含量就大为减少至消失。
3. 圣女果不宜空腹吃，空腹时胃酸分泌量增多，因番茄所含的某种化学物质与胃酸结合易形成不溶于水的块状物，食之往往引起腹痛，造成胃不适、胃胀痛。
4. 圣女果不宜长时高温加热，因番茄红素遇光、热和氧气容易分解，失去保健作用。
5. 圣女果不宜和青瓜、黄瓜同食，青瓜含有一种维生素C分解酶，会破坏其他蔬菜中的维生素C，圣女果富含维生素C，如果二者一起食用，达不到补充营养的效果。