心脏病患儿的症状主要依心脏缺损种类及严重度而定，常见情况为下列几种：
发绀
嘴唇发黑、四肢发紫、脸色暗蓝等为发绀症状，可能是肺部血流量不足或血管转位导致，通常必须立即开刀。
心跳快、呼吸喘、生长迟缓
若出现心脏衰竭，会造成肺部血流量增加，导致左心室的负荷较重，临床表现为心跳快、呼吸喘，也因为热量消耗大而造成生长迟缓。
肺水肿
当心脏结构异常，例如：静脉回流出现状况，可能造成呼吸急喘。另外，也会出现肺水肿，通常藉由心脏超音波检查诊断。
心脏有杂音
心杂音是心脏内血流所产生的声音。当心脏结构异常，例如：心室中膈缺损，造成心脏血液流动异常而出现杂音。