完整的鲜柠檬在5~8度环境下，一般可以存放6~8个月。如果切开后一次吃不完的柠檬，可以切片放在蜂蜜中腌渍，日后拿出来泡水喝。同时也可切片放在冰糖或白糖中腌渍，也可用来泡水喝。不过两种都要保证不要带水，否则有可能会烂掉。
因为榨好一次用不完的柠檬汁我们可以把口封紧放入冰箱中保存，而且时间限制在3天之内，如果时间长了会造成维生素C挥发。
但是如果想储存更久些，最好是将柠檬做成柠檬蜜;切片后放入干燥玻璃容器中，加入蜂蜜直至完全没过柠檬片，密封后放入冰箱里保存。因为这种蜜能较长期保存，可以保存一个月。切记保存过程中不能接触油脂和水。