火车司机撞死人要分情况处理。如果是故意撞死人，涉嫌故意伤害甚至是故意杀人，司机将会被判处刑罚。无违反交通规则，属于过失撞死人的，涉嫌交通肇事罪，也要承担刑事责任。无过失则为意外事件，不承担刑事责任。至于民事赔偿责任，如果是故意的，由火车司机承担，过失的，由单位承担。
法律依据：《刑法》第一百三十三条
违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役;交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑;因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。