1. 来源不同。
木糖醇是从白桦树、橡树、玉珠芯、甘蔗渣等植物原料中提取出来的一种天然甜味剂。
在自然界中，木糖醇的分布范围很广，广泛存在于各种水果蔬菜、谷类之中；而麦芽糖醇是由麦芽糖经氢化还原制成的双糖醇。第一部分是将淀粉水解制成高麦芽糖浆，第二部分是将制得的麦芽糖浆加氢还原制成麦芽糖醇。
2. 用途不同。
麦芽糖醇主要用于糖果、巧克力生产。由于麦芽糖醇的风味口感好，具有良好的保湿性和非结晶性，可用来制造各种糖果，包括发泡的棉花糖、硬糖、透明软糖等。木糖醇可代替糖按正常生产需要用于糕点、饮料。
实际生产中，木糖醇可作为甜味剂、湿润剂使用。制作需要有褐变的糕点时，可添加少量果糖。木糖醇能抑制酵母的生长和发酵活性，故不宜用于发酵食品。