1. 蒸馏法：目前使用的蒸馏器有玻璃、石英和铜等材料制成，蒸馏法只能除去水中非挥发性的物质，并不能除去溶解在水中的气体，而且，根据制备材料不同，所含杂质的种类和数量也不同，比如，用铜蒸馏器，水中会含有少量的铜离子，用玻璃蒸馏器制备，水中会含有少量的钠离子和硅酸根离子。
2. 离子交换法：用离子交换法制备的纯水称为去离子水，是目前用的比较多的一种方法，一般采用阴、阳离子交换树脂的混合床装置，这种方法的优点是：成本低、树脂可再生后反复使用，制备水量大，去离子能力强，但每种方法都有缺点，反渗透法也不例外，其缺点就是设备与操作比较复杂，而且不能除去有机物等非电解质杂质，并有微量树脂溶在水中。
3. 渗析法：渗析也叫渗透法，渗透是在外电场的作用下，利用阴阳离子交换膜对溶液中离子的选择性透过而使杂质离子从水中分离出来，现在用的比较多的是一种反渗透技术，反渗透能除掉90-99%的绝大多数污染物，但除去杂质的效率比较低，单独使用的话，只适用于一些要求不是很高的实验。