光合作用与呼吸作用的区别部位不同，光合作用进行的部分必须有叶绿体的细胞，因为叶绿体是进行光合作用的结构基础，形象地比喻为制造有机物的“机器”。呼吸作用所有的活细胞都要进行，细胞活着就要进行正常的生命活动，而生命活动需要能量支持才能正常完成，而这个能量是由呼吸作用分解有机物释放得来的，没有呼吸作用，细胞就不能正常生活，就会死亡。
呼吸作用与光合作用是相互依存的关系。如果没有光合作用制造的有机物，呼吸作用就无法正常进行。这是因为呼吸作用所分解的有机物正是光合作用的产物，呼吸作用所释放的能量正是光合作用储存在自机物中的能量。
如果没有呼吸作用，光合作用也无法正常进行。这是因为植物进行光合作用的时候，原料的吸收和产物的运输所需要的能量，正是呼吸作用释放出来的。