1. 保障额度不同：小额医疗险的保额通常比百万医疗险要低很多，通常只有不到2万的额度，而百万医疗险的额度比较高，高达百万。所以小额医疗险通常是用来报销日常的医疗费用，而百万医疗险则是用来报销大病产生的医疗费用。
2. 保险免赔额不同：小额医疗险的免赔额比较低，甚至有的几乎为0，只要患上规定的疾病，就可以获得报销。而百万医疗险的免赔额通常有一万，如果治疗费用没有达到一万，则无法报销，所以在实用性角度上分析，小额医疗险肯定是要比百万医疗险要高的。
3. 投保门槛不同：小额医疗险是健康告知是非常严格的，因为小额医疗险的报销门槛比较低，有些疾病患上的几率比较大，所以会责任除外或者拒保。但是对于百万医疗险来说，因为有1万元门槛费，所以保险公司的赔付风险会比较小，因此，百万医疗险对于投保者的身体要求会要稍微宽松一点。
4. 产品价格不同：小额医疗险的价格相比百万医疗险是要高的，因为它的报销门槛低，只要患上规定的疾病就可以理赔，所以保险公司承担的风险比较高，价格也因此增加不少。