补发工资计算个人所得税的话，目前的普遍做法是允许还原至所属月份计算缴纳个人所得税，计算公式为：所属月份补发工资应纳税额={[（所属月份补发工资+原所属月份的工资薪金所得）—费用减除额]×适用税率-速算扣除数}—原所属月份已缴纳的个人所得税。
【法律依据】
《个人所得税法》第九条规定，个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。纳税人有中国公民身份号码的，以中国公民身份号码为纳税人识别号；纳税人没有中国公民身份号码的，由税务机关赋予其纳税人识别号。扣缴义务人扣缴税款时，纳税人应当向扣缴义务人提供纳税人识别号。