1. 科属不同：薤白是被子植物门、单子叶植物纲、百合目、百合科、葱属植物；藠头是维管植物门、百合纲、天门冬目、石蒜科、葱属多年生鳞茎植物。
2. 外形不同：薤白鳞茎近圆球形，基部有许多小鳞茎，只有小指头大小，外层皮带点黑色，易掉落，里面的颜色呈白色，整体看起来扁一些，长的茎叶细小柔嫩，整体呈浅绿色；藠头鳞茎呈卵形或狭卵形，有许多差不多大小的鳞茎聚在一起，看起来想蒜瓣，外皮呈白色或带点红色，整体看起来长一些，长的茎叶细长，整体呈深绿色，一般会一大丛一大丛的生长。
3. 分布范围不同：薤白分布范围广，在我国大部分地区都有分布；藠头大多分布在长江流域或以南各省地区。
4. 吃法不同：薤白可以炒菜吃，也可代替葱炒肉吃，还可做腌菜吃；藠头大多用来做腌菜，当然也可做成罐头，吃起来酸甜可口。