不能。
夫妻双方在两地工作的 ，由于夫妻名下有房 ，要么选择一方按照首套住房贷款利息作为专项附加扣除 ，要么选择一方享受住房租金专项附加扣除 ，不能同时扣除首套住房贷款利息和住房租金。
根据相关的规定，纳税人及其配偶在一个纳税年度内不能同时分别享受住房贷款利息和住房租金专项附加扣除。且，第十八条规定，夫妻双方主要工作城市相同的，只能由一方扣除住房租金支出。
夫妻双方主要工作城市相同的，只能由一方（即承租人）扣除住房租金支出。夫妻双方主要工作城市不相同的，且各自在其主要工作城市都没有住房的，可以分别扣除住房租金支出。夫妻双方不得同时分别享受住房贷款利息扣除和住房租金扣除