1. 味道不同，红烧鱼是咸鲜味，糖醋鱼是酸甜味。
2. 鱼的品种不同，红烧鱼用的是草鱼，糖醋鱼用的是鲫鱼。
3. 制作过程不同：
红烧鱼制作方法为，草鱼洗净处理好，横切成小段，用酒和腌料腌2小时以上，油烧到8成热，将鱼段下入炸至酥黄，将卤汁烧开，小火熬成浓汁，取出八角桂皮，加入1大匙番茄酱煮开，将鱼段放入卤汁内，再加一点甜酒，小火收汁。
糖醋鱼制作方法为，鲫鱼清理干净，挨着头尾各切一刀，抽出筋，将鱼切成花刀，每隔两厘米左右竖切一刀，然后横着往里切1厘米左右，加入适量盐和料酒腌制半小时，生姜、大蒜瓣、大葱切成末，适量淀粉加入适量水，调成糊状，将鱼挂糊，锅里加入适量油，烧到五成热，下入鱼炸至两面金黄出锅装盘，锅里留少许底油，加入少许白糖，加入番茄酱、葱、姜、蒜末翻炒，加入适量生抽、少许蚝油、白醋，加入少许水烧开，加入水淀粉翻匀，将糖醋汁淋入即可。