在申请主体方面，订阅号是企业或组织、个人等都可以申请，服务号只能是企业或组织等属于官方机构的主体才能申请，但凡是个人注册公众平台全为订阅号。
在两者功能上，二者在微信端展现方式不一样，订阅号每天都可以发消息，发送消息后，所有订阅号都被收集到了一个文件夹中，不再单独展示，也无即时提醒，可以当成杂志看，而且被折叠了，想看就看，不想看就不打开。
服务号适合做服务，发消息有限制，群发一个月4条，推送的消息后，可以直接在接收消息列表中展现出来，并有提醒，但用户对服务号信息比较挑剔，因为会显示在第一屏，如果消息质量差，很容易被取消关注。