南方科技大学是一所以理工科为主、兼具部分特色人文社会学科与管理学科的大学。
学校系科和学科专业设置紧跟学科发展前沿，面向国家战略性新兴产业发展，重点发展与新能源、新材料、新一代信息技术、节能环保、生物技术与生物医药等相关的新兴学科专业和交叉学科。
目前设置数学系、物理系、化学系、生物系、电子与电气工程系、材料科学与工程系、金融系、环境科学与工程学院、海洋科学与工程系、力学与航空航天工程系、机械与能源工程系、计算机科学与工程系、生物医学工程系、地球与空间科学系等14个院系，开设物理学、化学、生物信息学、生物技术、生物科学、生物医学工程、金融数学、微电子科学与工程、光电信息科学与工程、通信工程、材料科学与工程、金融学等22个专业。