运用足底按摩疗法要掌握好时间，根据病种，病情和病人体质等情况确定按摩时间。慢性，顽固性疾病，按摩时间宜长些;急性病，病因明确单纯，按摩时间可短一些。
一般来说，每个穴位或病理反射区按摩2-3分钟即可;但对肾，输尿管，膀胱，肺反射区必须各按摩2分钟或100次左右，以加强其泌尿功能，促使体内有毒物质顺畅排出体外。对严重的心脏病患者， 在心脏反射区按摩1分钟即可，加上其他穴位或反射区，总共不超过10分钟;对于患有严重糖尿病，肾脏疾病的病人，总的按摩时间也不要超过10分钟;对脊椎的每个反射区只需按摩2-3分钟就足够了;按摩肝脏反射区时，必须注意在病人肾脏功能良好的情况下，才可以按摩五分钟或更长时间，否则不利于体内毒素的排泄。