隋文帝建立隋朝后，选其为爱子晋王杨广之妃。
萧后婉顺聪慧、知书达礼，又通医术，颇知占侯，深得文帝夫妇欢心和丈夫杨广宠爱，诞育三子一女，并为夫夺嫡立下汗马功劳。
隋炀帝即位后，萧后虽年过四十，仍得到其宠爱和敬重。
炀帝之后多有失德，萧后婉谏无果。
江都之变炀帝遇害后，五十多岁的萧后带着幼孙和皇室诸女，先后流落于叛军宇文化及、窦建德处，后义成公主迎其至东突厥，流亡突厥的隋百姓奉炀帝孙杨政道为主，萧后与其居定襄。
唐贞观四年李靖灭东突厥，萧后等归长安，居长安城兴道里。
萧后于唐贞观二十一年去世，唐太宗以皇后礼将其与炀帝合葬扬州，谥曰愍。