如果房屋维修基金发票丢了是可以补办的，补办丢失维修资金专用收据程序：
1. 到维修基金窗口，补办人本人携带身份证、备案合同、购房发票进行查档核实，如确认已交，由窗口工作人员给予出具登报声明作废的手续。
2. 到当地的报社登报声明丢失收据作废。
3. 拿刊登丢失票据声明作废的报纸，再回到维修资金窗口，并附带出具登报手续复印件及本人身份证原件和复印件，由窗口工作人员审核合格后，留存报纸、登报手续复印件、身份证复印件。然后，窗口工作人员到局财务科进行办理。
4. 补办时间为20个工作日，由本人携带身份证领取补办收据。