由于棚户区改造房属于安置房的一种，根据相关政策规定，这类房产在五年内不能买卖。期满，业主缴纳相关税费后，可申请办理房产证，拿证后的房产和普通住房没有差别，可正常买卖交易。棚户区改造房的价格往往低于市场房价，算是福利性住房的一类，因此在买卖交易中，很少人会在未取得房产证的情况下，去购买这类房产，所存在风险实在太大，容易对自身利益造成影响。
棚户区改造房很难确权，需要漫长的一段时间，可办理房产证，但流程比较麻烦。因为它的性质、拿地的方式、产权的不同，所以不能按照同一种方法来处理。但可参照这些点来作出判断，若能提供产权证，就可进行房产交易。但其中一部分的棚户区改造房是小产权房，也就是使用集体土地来建造的，这类情况的房产，个人往往无法办理过户，因为产权属于集体，只有房屋所有权属于个人，所以这类性质的房产不能正常交易买卖。