合肥工业大学是教育部直属的全国重点大学，是国家“211工程”重点建设大学。2009年4月学校决定按照教育部和国家发改委有关试办“国家示范性软件学院”要求和标准成立软件学院，并从2009年学院开始招收软件工程专业本科生。
学院积极探索新型办学理念和办学模式。发挥合肥工业大学在信息学科领域自身、交叉和融合的优势，加强和国内外大学合作，采用国际上最新优秀教材，聘请校内、国内外著名大学教授和著名软件公司的软件专家和管理专家授课；强化英语教学，强化在软件实习基地的项目研发实践教学。
学院秉承合肥工业大学“厚德、笃学、崇实、尚新”的校训，坚持质量至上原则，遵循高等工程教育的内在规律，借鉴国际先进经验，以培养“多层次、实用型、复合型、国际化的精英型软件工程人才”为目标，注重办学特色，严格培养质量。