是的，需要清洗根系。
生长在水中的花卉的根系一方面吸收水中的养分，另一方面向水中排放一些有机物、废物或毒素，并在水中沉积。这些有机质在土壤栽培过程中主要溶解在土壤中，不易被根系吸收，而废物和毒素则分布在土壤缝隙或从盆底漏孔中流出，不会被根系吸收。被根系吸收，影响正常开花、生长。而水培容器没有底孔，这些有机物、废物或毒素沉积在水中，很容易再次被植物吸入。这种反复吸收、排泄、再吸收、再排泄的恶性循环，对花卉的正常生长非常不利。
此外，水培花卉常施于水中的养分肥料，除部分被根系吸收的矿质元素外，其余部分留在水中。当残留物质达到一定量时，也会对花卉造成一定的危害。长期在水中生长的水培花卉的根系也会产生一种粘液，不仅影响花根对养分的吸收，还会污染水体。基于以上原因，水培花卉要定期换水清洗根部。