原料不同
藕粉主要是由莲藕的肥大根茎制成的，而葛根粉则是由豆科植物野葛的块根制成的淀粉，营养价值比较高，既可以食用也可以药用。
营养成分不同
藕粉中含有大量的维生素、淀粉、多糖、蛋白质、脂肪、碳水化合物、粗纤维、氨基酸及多种矿物质元素等营养成分物质，而葛根粉中含有丰富的蛋白质、维生素、纤维素、胡萝卜素、黄酮素、氨基酸以及钙、铁量等营养成分物质。
颜色不同
藕粉的颜色主要是白色为主，但要是长期暴露在空气中，那么藕粉就会被空气氧化，从而有点微红，而葛根粉颜色种类较多，有白色或者微黄色，有时候还会添加一些色素。