1、消化不良
黑芝麻丸富含油脂，油脂是最难消化的食物成分，蛋白质也不易于消化，大量食用本来就难以消化，增加肠胃负担。对于肠胃不好或消化功能不好的人群而言，一次性食用大量芝麻丸，油脂和蛋白质在肠胃中堆积，难以消化。
2、发胖
芝麻的热量高达每100克559大卡，脂肪含量为百分之四十六，蛋白质含量百分之十九，如果大量食用，身体摄入了大量的油脂和蛋白质，增加了很多的热量，额外的能量就会转化成脂肪堆积在人体各个部位中，进而可能会造成超重、肥胖、脂肪肝发生的风险增加。
3、上火
黑芝麻丸是用炒熟的黑芝麻制成的，其热气比较旺盛，如果大量食用会导致上火，出现眼睛红肿、口角糜烂、尿黄、牙痛、咽喉痛等症状。
4、内分泌紊乱
黑芝麻油脂较高，如长期大量食用黑芝麻丸还可能引起内分泌紊乱，皮脂腺分泌增加，导致油脂分泌增多的现象，可能导致患者皮肤长痘、头皮出油和瘙痒等。