从包装上区分
一般这三种口罩都有不同的技术标准，《一次性使用医用口罩》为（YY/T0969-2013），《医用外科口罩》为（YY0469-2011），可以通过查看产品外包装上标注的执行标准来判断产品属于哪类口罩，另外包装上也会写清各自的名称。
性能有所不同
这两类口罩都可以对细菌具有过滤的作用，但是它们在防水性和颗粒过滤效率两个方面有所不同。首先，一次性医用口罩则没有防水性与颗粒过滤效率两个方面性能的要求，而医用外科口罩有要求。医用外科口罩可防止手术中产生的血液、体液的喷溅物对医生的感染。
作用不同
一次性使用医用口罩仅适用于一般诊疗操作时阻隔操作者口腔和鼻腔呼出的污染物，即是没有侵入性操作时使用，临床医院人员在工作中一般佩戴这种口罩。医用外科口罩具有良好的防水性能以及颗粒过滤效率，适用于手术、激光治疗、隔离及牙科或其他医疗操作时的佩戴，以及空气或飞沫传播疾病或者佩戴；主要满足医院手术操作人员使用。