智慧团建设置管理员的方法是：
1. 未注册的团干部可以通过“管理员注册”的方式进入系统并成为组织的管理员，上级组织管理员为本组织生成管理员注册码。
2. 在系统登录页面点击“注册”按钮，选择“管理员注册”功能；按系统的指引注册成为管理员。
3. 已注册的团干部可以由组织管理员，通过管理员变更的方式，变更成为管理员，管理员进入“管理中心”，选择“业务办理”，点击“管理员变更”。
4. 选择需要变更管理员的组织，再点击“添加管理员”；若给本组织添加管理员，提交申请后需要上级管理员审批，审批通过方可生效；若给直接下级组织添加管理员，提交后立刻生效。
注意：管理员必须是团干部，只有当团组织中有团干部才可以设置，若团组织中无团干部需要先添加团干部。