房产证能区别商业用地，说明如下：
1. 商业用地办理的房产证对比一般房产证，特殊在于商业用地的土地使用年限是40年，相较住宅用地70年要少。
2. 在房产证中用途规划一栏也可以对房产性质进行区分，会填写商业用途。
相关说明：
商业用地是指规划部门根据城市规划所规定该宗地块的用地性质是用于建设商业用房屋的土地。出让后用地的使用年限为40年。住宅用地土地使用权最高年限70年，要想把商业用地改变成住宅用地缴土地出让金是肯定的，要想把一套房屋改变土地使用性质是不能的。
房产证是指购房者通过交易，取得房屋的合法所有权，可依法对所购房屋行使占有、使用、收益和处分的权利的证件。是国家依法保护房屋所有权的合法凭证。房屋所有者凭证管理和使用自己的房屋。