1. 笔芯性质不同：碳素笔笔芯内是油性物质，中性笔笔芯内是水性物质。
2. 可替换性不同：中性笔替换笔芯，碳素笔不可以。
3. 字迹保存时间：碳素笔字迹保存时间长，字体不会变得模糊，中性笔字迹保存时间比碳素笔短。
中性笔
中性墨水圆珠笔的简称，起源于日本，是东亚较为流行的一种新颖的书写工具。按笔头类型、墨水色彩、结构等又可分为不同类型的中性笔，大家可以根据自己的需求选择。中性笔兼具自来水笔和油性圆珠笔的优点，书写手感舒适，油墨粘度较低，并增加适当润滑剂，书写介质的粘度介于水性和油性之间，因而比普通油性圆珠笔更加顺滑，是油性圆珠笔的升级换代产品。中性笔芯尾部的油状物叫中性笔尾油锂基酯，其作用如下：保持良好的保湿密封，防止墨水蒸发或倒流溢出。在中性笔书写时，锂基酯能像活塞一样随时跟进，利用大气压将墨水往下压，保持中性笔书写流畅，直至墨水书写完。