筷子发黑通常是因为通风不够，长期潮湿导致霉菌滋生，是可能会沾上黄曲霉毒素的。因为我们常吃的淀粉类主食，如果粘在筷子上没有及时清洗干净的话，就容易霉变产生黄曲霉。而黄曲霉毒素是一类致癌物质，是一种剧毒物质，对人和动物的肝组织有破坏作用，严重时可引起肝癌甚至死亡。所以如果筷子发黑发霉了一定要彻底清洗干净了使用。
家用筷子经常使用并长时间用水冲洗，导致筷子的水含量极高，很容易成为细菌（例如金黄色葡萄球菌和大肠杆菌）的温床。 筷子在柜子中长期存放可能会使筷子变质的可能性增加五倍以上。 一般来说，筷子使用六个月后即可更换。