与安眠药相比，褪黑激素相对安全。
因为褪黑激素从种类上看是保健食品，而安眠药是药物；与成分相比，褪黑激素含有维生素B6和褪黑激素，而安眠药含有巴比妥酸衍生物、水合氯醛、甲丙氨酯；由于褪黑激素中所含的成分，褪黑激素有助于改善睡眠质量，而且由于安眠药的特殊成分，安眠药可以专门促进睡眠。
在功效方面，褪黑激素和安眠药也有不同的功效。
褪黑素的主要作用是产生一种诱导睡眠的激素，服用后的副作用比较小；安眠药的主要作用是抑制大脑的中枢神经系统。
副作用大，严重时会危及人的生命。
建议患者服用前请听从专业医师的指导，以免使用不当对身体造成伤害。