鱼的品系大体可分为草种、文种、龙种、蛋种和龙背种五大类。
1. 草种金鱼：又称金鲫种。它是金鱼的祖先，外观体形似鲫鱼，身体扁平纺锤形，背鳍正常，尾鳍单一。 草种分两型，一类短尾为金鲫型，另一类长尾燕尾型。
2. 文种金鱼：一般身体较短，各鳍较长，又背鳍，尾鳍分叉为四；眼球平直不突出。名贵品种有鹤顶红、珍珠、虎头等。
文种分六大类：头顶光滑为文鱼型；头顶部具肉瘤为高头型；头顶肉瘤发达包向两颊，眼陷于肉内为虎头型；鼻膜发达形成双绒球为绒球型；鳃盖翻转生长为翻转型；眼球外带有半透明的泡为水泡眼型。
3. 龙种金鱼：外形与文种相似，不同处为眼球凸出于眼眶外。自古以来视龙种为金鱼正宗。龙种金鱼有50多个品种，名贵品种有风尾龙睛、黑龙睛、喜鹊龙睛、玛瑙眼、葡萄眼、灯泡眼等。
龙种分七型：光顶光滑为龙睛型；头顶部具肉瘤为虎头龙睛型；鼻膜发达形成双绒球为龙球型；鳃盖翻转生长为龙睛翻鳃型；眼球微凸，头呈三角形为扯旗蛤蟆头型；眼球向上生长为扯旗朝天龙型；眼球角膜突出为灯泡眼型。
4. 蛋种金鱼：外形与鲫鱼有较大差异。体短而肥，眼球不凸出，背部平直无背鳍。名贵品种有红蛋、绒球蛋、凤蛋、水泡眼、狮子头等。
蛋种分七型：尾短为蛋鱼型；尾长为蛋凤型；头部肉瘤仅限于顶部为鹅头型；头部肉瘤发达并包向两颊，眼陷于肉内为狮头型；鼻膜发达形成双绒球为蛋球型；鳃盖翻转生长为翻鳃型；眼球外带半透明泡为水泡眼型。
5. 龙背种金鱼：外形与蛋种相似，不同处为眼球凸出于眼眶外。名贵品种有朝天龙、龙背、龙背灯泡眼、虎头龙背灯泡眼、蛤蟆头等。
龙背种分七型：尾短为龙背型；头顶具肉瘤为虎头龙背型；鼻膜发达形成双绒球为龙背球型；头呈三角形为蛤蟆头型；眼向上生长为朝天龙型；鳃盖翻转生长为龙背翻鳃型；角膜凸出为龙背灯泡眼型。