牡丹剪下的枝干可以进行扦插。
牡丹扦插繁殖成活率低，生根量小，生长势弱，养护管理难度大，因此生产上几乎不采用。
扦插繁殖的最佳时间为9月上旬（白露）到9月下旬（秋分），这时气温为18～25℃，地温18～23℃，只要插床基质墒情适中，7～10天可以形成愈伤组织，插后50～60天，可以长出4～10条新根，但新根短、细、嫩。到12月份时，根部基本停止生长。扦插时，插穗要选取粗壮无病虫害的，地表处的萌蘖枝做插穗更易生根。每个插穗长5～10cm，用500～800mg/L的吲哚丁酸、ABT1号生根粉等生根剂速蘸，然后以株行距10×20cm插入基质中，插入深度为插穗长的1/2～2/3，压实基质，保持湿润。
牡丹扦插繁殖的成活率一般不超过60%，主要原因是扦插后当年新生根少而短，无法满足植株生长所需的足够的水分和营养，从而造成死亡。牡丹扦插成活两年后，可以移栽到大田定植。