从安全程度来看，二者没有区别，都是比较安全的。
两个都是货币基金，风险是一样的，从收益来看，还是理财通较高，但在使用方面，余额宝的钱可以直接购物，到账时间根据具体银行具体额度，一般当天到账，超过五万可能自动默认第二天。
理财通的到账时间会根据时间段来分，看你对资金流动性的要求了。
两个收益差不了太多。
还有比较关键的一点，近期都有再说，如果你的手机丢了，很可能被别人盗取支付宝的密码，那里面的资金就不安全了，别人可以转出到自己的银行卡，但是理财通，即便微信被别人登录了，里面的钱还是只能退回到买入的卡里面。