若是煮过的饺子馅可选择冷藏，没煮过的要冷冻。菜品切碎做馅后接触细菌更多，因此没煮过的饺子馅千万不能室温存放，否则可能变质。建议把没煮过的饺子馅放到冰箱冷冻室保存，否则要煮熟杀菌，再冷藏保存。为防煮熟的饺子馅在储存时产生亚硝酸盐，冷藏的饺子馅要尽快吃完。吃的时候一定要通过蒸或煎炸的方式高温杀菌。
饺子吃不完保存方法：
如果是生饺子，可以先整齐地将饺子排列在撒有薄粉的长盘内，移入冷冻室冷冻1小时，待其外皮干硬时，装入塑料袋内冷冻。如果是煮熟而未吃完的饺子，拌入少许色拉油，这样可以避免饺子粘在一起，然后装袋放入冷藏室。另外，刚从冷冻室取出的饺子十分坚硬，可以稍放片刻让它解冻，煮饺子的水不用等到开，水温时就可以将冷冻饺子直接放入，利用温水的润化使饺子皮慢慢回软，直到水开并浮起时再点水即可。