主要区别在于配置区别、数量区别。
1. 配置区别：一等座是高铁的一种高等席别，包厢内共设六个座位。四周完全封闭，顶上开放，提供早午餐。动车二等座是中国国家铁路客运列车座位等级中的一种类型，全部设置在国铁线上运营的动车组车厢内，因此又被称为动车（组）二等座。
2. 数量区别：一等坐席每排4个座位，采取“2+2”布局，二等座采取的则是“3+2”布局。
高铁：
高铁在不同国家、不同时代以及不同的科研学术领域有不同规定。中国国家铁路局颁布的《高速铁路设计规范》文件中将高铁定义为新建设计时速为250公里（含）至350公里（含），运行动车组列车的标准轨距的客运专线铁路。中国国家发改委将中国高铁定义为时速250公里及以上标准的新线或既有线铁路，并颁布了相应的《中长期铁路网规划》文件，将部分时速200公里的轨道线路纳入中国高速铁路网范畴。