由于鸭蛋中含有不少的胆固醇，大量食用容易或导致体内胆固醇含量增加，不利于身体健康，因此不建议食用鸭蛋的时候再吃一些常见富含胆固醇的食物。
常见的富含胆固醇食物有：皮蛋黄、咸鸭蛋黄、鸡蛋黄、鹌鹑蛋黄、鹅蛋、猪肾等。
鸭蛋中含有丰富的蛋白质和磷元素，食用之后，会在体内分解生成嘌呤，增高人体内的单钠尿酸盐含量，容易引起或者加重关节和身体的不适情况，因此建议本身体内尿酸高或者患有痛风的人群避免大量食用。
常见的富含嘌呤的食物有：肝脏、大肠、白色浓汤、动物脑子、肾脏、沙丁鱼、鱼籽、香菇、紫菜等。
鸭蛋是一种富含蛋白质的食物。其中蛋白质含量只比鸡蛋少一点点，适当吃些可以补充蛋白质，但是若是与一些富含鞣酸含量的食物一起食用，会在体内反应生成不易消化的凝固成分，进而加重消化的负担，一些肠胃较差的人群食用之后会出现消化不良等身体不适的情况。
常见的富含鞣酸的食物有：葡萄皮、柿子、生香蕉、酸李子、酸布林、酸枣、香椿、竹笋等。