1. 清水浸泡：新鲜的折耳根如果是短时间保存可以将折耳根全部散开铺在地面上，避免堆积在一起，容易腐烂，在摊开的折耳根上洒适量的清水，保持它的水分，不至于让水分流失。或直接用小盆装水放在盆里泡着，不过不宜储藏过久，一般在3—5天左右。
2. 冷藏保存：在气温比较高的情况下可以把新鲜折耳根择去杂质，晾干表面水分以塑料袋包裹，置于冷藏库中存放。
3. 腌制晒干保存：新鲜的折耳根如果量比较大可以用山西陈醋和盐拌匀腌一个晚上，然后后再放到太阳下去晒。等鱼腥草晒到七八分干时，再放辣椒粉和甘草粉拌匀，再晒，收好放进玻璃瓶里，移入冰箱冷藏保存。吃的时候抓出一把就可以直接食用了，很是美味。